Das Webspecial führt die inhaltliche Leitlinie des Spiels weiter: Die Microsite erscheint als Schatzkarte mit Kompass-Navigation. „The Legend of Zelda: Phantom Hourglass“ wird auf dem Nintendo DS ausschließlich per Touchpen gespielt. Um dies zu verdeutlichen, verfügt die Site über eine Reihe von Videoausschnitten und Animationen, in denen die Touchpen-Bewegungen im Vordergrund stehen. Ein zusätzliches Feature motiviert den User, selbst zum Abenteurer zu werden: Auf der Microsite sind Sanduhren versteckt, die es einzusammeln gilt, um zusätzlichen Premium-Content freizuschalten.